Es el medio electrónico en el cual el personal de salud registra, anota y certifica su intervención relacionada con el paciente de acuerdo con las disposiciones sanitarias. Permite la gestión de un único registro de salud longitudinal de cada paciente en un formato digital. 

Ventajas: 

1. Constituyen una herramienta disponible para los trabajadores de la salud que les permite compartir los recursos. 

2. Ayuda en los sistemas de apoyo a la decisión clínica y a los sistemas de prescripción electrónica asistida. 

3. Mejora el intercambio de información de la salud.

4. Apoya a la mejora de la calidad de la atención en la reducción de los errores médicos. 

5. Reducen la probabilidad de pérdida de la información. 

Regulación del ECE: la norma oficial mexicana NOM establece los lineamientos del expediente clínico electrónico. Estos se deben de observar para garantizar la interoperabilidad, el procesamiento, la interpretación, la confidelidad, la seguridad y el uso de estándares y catálogos de la información.